Dentro de la reserva se identificaron 142 especies que representan el 35% del total de especies registradas para la provincia. Entre éstas, sobresale una población estable de Cóndor Andino (Vultur griphus) y la presencia de Águila Coronada (Haryphyliaetus coronatus), además de una amplia variedad de rapaces y registros de especies en peligro a nivel nacional e internacional.
Se calcula que la zona alberga más de 200 especies de animales entre las
cuales, utilizando como criterio su estatus de conservación, vulnerabilidad, y dada su importancia para el valor biológico de un ecosistema y como elementos de conservación (Kufner, 2008), propone como es- pecie bandera de la reserva el Águila coronada (Harpyhaliaetus coronatus).
El Cóndor Andino, el halconcito gris, Puma y gato de pajonal como representantes para conservación en la región.
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